云南省扶贫基金会构建了层级清晰、权责明确、运转高效的组织架构体系。基金会设理事会与监事（会）作为最高决策和监督机构，为基金会规范运营提供坚实的决策支撑与专业的监督保障。理事会下设理事长、副理事长、秘书长，统筹主持基金会日常运营管理与整体工作运行。监事（会）履行监督职能，对基金会合规管理、财务收支、三重一大等工作进行全程监督。执行层面设综合办公室、项目管理中心、宣传筹款办公室三大核心职能部门，各部门各司其职、协同联动，全面落实基金会各项工作任务，保障基金会公益使命合法合规、有效落地。决策机构、监督机构和执行机构之间权责明确、相互协调、相互制约。